篝弥市は北高に入学した夜島学郎には、小さい頃から、変なものが見えていた。この世ならざる者、幻妖。
彼は入学した高校にて幻妖に襲われるも、謎の美女、鵺に助けられる。彼女の正体は幻妖で、この学校に封印されているのだという。
「この学校に集まる幻妖を倒して欲しい」
そう頼まれるが、幻妖に幼少期の体験からトラウマを持つ学郎には、受け入れることができなかった。
日常に戻ろうとする学郎だが、級友が幻妖に襲われているのを目の当たりにし、鵺の申し出を受け入れる決意をする。
こうして鵺とタッグを組んだ学郎の学園生活は、一変していくことになる。